陵水黎族自治县历史悠久，早在新石器时期，已有先民繁衍生息。唐扈三代为南交之地，秦为象郡外缴，汉为詹耳郡地。西汉武帝元封元年（公元前110），汉军平定越地在海南岛上置珠崖、詹耳两郡，领十六县，陵水属珠崖郡山南县。汉元帝初元三年（公元前46），改珠崖郡为蛛卢县，属合蒲郡。唐武德五年（622），置崖、詹、振三州，陵水县属振州。龙塑二年（662），置万安州，陵水改属万安州，五带因之。宋熙六年（1073）改万安州为万安军，领万安、陵水等四县。宋高宗绍兴六年（1136），废万安军，陵水县改属琼州。绍兴十三年（1143），复设万安军，陵水县还属万安军。元因之。明洪武三年（1370），升琼州为府，陵水县属琼崖妥蜻处，国民二年（1913），陵水县属琼州镇守府。从民国十年（1921）始，陵水县先后归属琼崖善后处、琼崖妥蜻委员公署，广东省第九行政督察委员公署，海南特别行政区。1927年至1931年间，陵水县苏维埃政府成立，建置四年。1945-1946年成立陵保县抗日民主政府，建置2年。1948-1950年4月，成立陵水县民主政府，建置二年。1950年4月28日，陵水县解放。1951年8月14日成立陵水县人民政府，隶属海南行政区。1954年1月隶属海南黎族苗族自治州。1958年12月，陵水、崖县、保亭三县合并为榆林县，次年2月改称崖县，隶属海南行政区公署。1961年6月1日，陵水从崖县分出，恢复陵水县建制。1962年，海南黎族苗族自治州恢复，陵水县隶属海南黎族苗族自治州。

      1987年12月，陵水县改称陵水黎族自治县。此期间海南黎族苗族自治州撤消，陵水黎族自治县隶属广东省海南行政区。1988年4月，海南建省，陵水黎族自治县隶属海南省。